| nombre | aeropuerto principal | imagen | Fecha cese operaciones | Fecha inicio operaciones | Código IATA | Código OACI | ciudad sede | división administrativa sede | país sede | continente sede | País | continente | matriz | Número de aviones | Número de destinos | Sitio web |
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| Avies | Aeropuerto de Tallin |  | 2016 | 1991 | U3 | AIA | Tallin | Harju | Estonia | Europa | Estonia | Europa | 11 | 12 | Website | |
| Estonian Air | Aeropuerto de Tallin |  | 08/11/2015 | 1991 | OV | ELL | Tallin | Harju | Estonia | Europa | Estonia | Europa | 7 | 14 | Website | |
| Aero Airlines | Aeropuerto de Tallin |  | 2008 | 2002 | EE | EAY | Tallin | Harju | Estonia | Europa | Estonia | Europa | 3 | Website |